10x Visium空间转录组测序服务简介
项目介绍
在多细胞生物中,基因的表达具有时间特异性和空间特异性,细胞及其在组织样本中的相对位置之间的关系对于理解疾病病理 、细胞生物学、发育生物学、肿瘤生物学等至关重要。而常规转录组测序和单细胞转录组测序都无法实现细胞所处的原始位置信息的检测,且传统的原位杂交技术通量比较低。来自10x Genomics公司的Visium空间基因表达解决方案,提供了分析空间整体转录组的方法, 该方案通过将基因表达数据与形态H&E染色的图像相叠加,研究人员可同时获得细胞的空间位置信息和基因表达数据,且不需要制备单细胞悬液,进一步推进了对组织原位细胞真实基因表达的研究,实现了对细胞空间异质性的全面描述。
主要流程
1、订购流程

备注:
1、《高通量测序送样表-空间转录组测序 》可从下载专区获得
2、填写好的表格需发送至项目助理邮箱:rna_sample@sangon.com"
项目流程
1.新鲜组织冷冻包埋(FF样本)

2.FFPE样本

订购信息
项目名称 | 目录价 | 周期 |
空间转录组测序 | / | 50个工作日左右 |
样品类型
1.FF样本 :真核物种新鲜组织样本
2.FFPE样本 :有物种限制
最终交付
交付信息
1.测序原始数据
2.实验结果类文件
3.分析报告及分析结果文件
分析结果示例

图1. 点阵质控

图2. 降维聚类UMAP图(左)和cluster空间映射图(右)

图3 特异基因表达可视化