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单细胞免疫组库测序服务简介

项目介绍

免疫组库(Immune repertoire,IR)是指在任何指定时间,某个个体的循环系统中所有功能多样性B淋巴细胞和T淋巴细胞的总和,反应机体在特定时间段应对外界刺激应答的能力。传统的免疫组库研究通常是通过多重PCR技术或5’RACE扩增分析BCR或TCR多样性的互补决定区(CDR3区),往往只能检测TCR或BCR一条链的序列信息。而单细胞免疫组库测序能够在单细胞的层面研究机体免疫机制,可较为全面的揭示TCR/BCR的多样性和复杂性,是免疫组库研究中的一个重要手段。目前基于10x Genomics公司的单细胞免疫组库解决方案,可实现高通量的单细胞V(D)J测序,不但可以将TCR/BCR双链完美匹配,而且可以细化到单细胞水平,还同时可获得基因表达信息。
技术支持 电    话:021-57072059 021-57072177 021-57072097 E-mail:RNAseq@sangon.com RNAseq2@sangon.com

主要流程

1、订购流程

备注:
1、《高通量测序送样表-单细胞免疫组库测序 》和《上门服务信息确认表-单细胞免疫组库测序》可从下载专区获得
2、填写好的表格需发送至项目助理邮箱:rna_sample@sangon.com

2、项目流程

订购信息

样品类型及运输条件

1、样本类型

注意事项:
1、物种适用性:单细胞免疫组库测序只适用于人或小鼠的样本;
2、用于制备单细胞核悬浮液的样本无法进行单细胞免疫组库实验;
3、V(D)J 建库建议先进行 T/B 细胞流式分选或磁珠富集,未富集样本不会影响 5'转录组数据,但 T/B 细胞占比过低会
     导致TCR/BCR 文库建库失败。

2、常见样本运输方式

3、提供信息:纸质版样品信息表;无致病性证明。

最终交付

交付信息

1.测序原始数据
2.实验结果类文件
3.分析报告及分析结果文件

分析结果示例

图1. V-J 基因使用热图

图2. V-J 基因使用弦图

图3.V-J基因使用频率条形图

图4. V-J paris使用冲击图

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