SMART-seq2 服务
项目介绍
技术原理
SMART-seq（Switching mechanism at 5’ end of the RNAtranscript）是由美国和瑞典科学家于2012年共同开发的一种单细胞转录组测序技术，其能够检测mRNA 的全长，从而实现了转录本异构分析分析和 SNV 检测。2013年，Nature Methods 杂志上报道了 SMART-seq2，该技术是经 SMART-seq 改进的一种测序方法，也是目前最常用的单细胞转录组技术之一。
该技术通过设计 oligo（dT）VN Primer 作为逆转录引物，利用 MMLVRT 的模板转换活性，在 cDNA 的3’端添加一段接头序列，通过该接头序列进行反转录，生成 cDNA 第一条链。当逆转录酶到达mRNA 5’末端时，会连续在末端添加几个胞嘧啶（C）残基。然后添加 TSO 引物，退火后结合在第一条链的3’端与 poly(C) 突出杂交，合成第二条链。这样得到的 cDNA 经过 PCR 扩增，获得纳克级的 DNA，纯化后可用于测序。
技术特点
适用于低起始量
一个细胞起始（100个以内的少量细胞），适用于难以满足10x Genomics 等高通量平台起始细胞量要求的样本；
可检测 mRNA 全长
测序可覆盖全长 cDNA 序列，单个细胞检测基因数量多，可达上万个；可用于基因结构分析，比如可变剪切
图1 SMART-seq2原理
主要流程
订购流程
备注：
1、《高通量测序送样表_SMART-seq2送样表》可从下载专区获得
2、填写好的表格需发送至项目助理邮箱：rna_sample@sangon.com
1、《高通量测序送样表_SMART-seq2送样表》可从下载专区获得
2、填写好的表格需发送至项目助理邮箱：rna_sample@sangon.com
项目流程
订购信息
| 项目名称 | 目录价 | 周期 |
| SMART-seq2 | - | 40个工作日左右 |
客户提供
提供样品类型及运输条件。
样本要求
（ 1 ）物种：真核生物
（ 2 ）细胞：推荐1-100个单细胞
保存运输
细胞放入 SMART-seq2 试剂盒指定的裂解液中，-80°C 保存，干冰运输。
（ 1 ）物种：真核生物
（ 2 ）细胞：推荐1-100个单细胞
保存运输
细胞放入 SMART-seq2 试剂盒指定的裂解液中，-80°C 保存，干冰运输。
最终交付
交付信息
1.测序原始数据
2.实验结果类文件
3.分析报告及分析结果文件
2.实验结果类文件
3.分析报告及分析结果文件
分析结果示例
图1基因表达相关性 heatmap 图
图2表达相关性散点图
图3 差异基因 Heatmap 图
图4差异表达基因的 GO 功能分类统计图
图5差异表达基因 GO 富集气泡图