small RNA测序
项目简介
Small RNA是一类重要的体内调节分子,长度在18-30 nt之间,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,从而调节细胞生长、分化,以及个体发育、生殖等重要生物学过程。高通量测序技术可以对样本中所有small RNA家族进行测序和表达定量,从而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非编码RNA以及相应靶序列。
技术支持
Tel: 021-57072097
021-57072177
E-mail: rnaseq@sangon.com
rnaseq2@sangon.com
测序使用Illumina Xten平台,测序原始数据质控后,进行Clean reads 长度分布统计,small RNA注释,已知 miRNA 注释,已知piRNA注释,ncRNA分析,新 miRNA 预测(有参考基因组),差异基因可视化分析,miRNA 家族分析,差异表达 miRNA 聚类分析,miRNA靶基因预测,靶基因GO、KEGG富集分析。
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- 样本要求
- 常见问题
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实验流程
订购信息
客户提供
提供样品
组织样品或者总 RNA, 样品名称清晰,干冰运输。 具体要求参看官网高通量测序介绍页面中的《RNA类高通量测序样品要求》。
提供信息
告知物种信息以及对照与实验样品(如有分组,详细描述分组分析信息)
交付
测序原始数据
实验结果类文件
分析报告以及分析结果文件
部分发表文章用的方法描述