项目介绍

近年来，菌落16S高通量测序技术为3499拉斯维加斯官网提供了群落的菌群结构、进化关系以及群落多样性研究的有效手段，极大地拓宽了3499拉斯维加斯官网对微生物群落结构及功能的认识。但目前高通量测序分析结果往往只有微生物分类及其相对丰度，只表征了一个样本中微生物类群的相对比例，不能确定不同分类水平微生物的绝对含量，当样本间总微生物绝对含量存在差异时，可能会得出错误甚至相反的结论。有些学者利用通量量测序结合流式细胞仪、菌落磷脂脂肪酸含量等方法同时对群落微生物进行相对丰度与绝对定量，每种方法都有其局限性，如很多实验室不具备流式细胞仪实验条件，菌落中不同菌的磷脂脂肪酸含量有较大差异，Yang L（Science of the Total Environment 633, 2018）开发一种高通量绝对定量检测方法（HAAQ），HAAQ方法的特点就是在样品加入环境样品没有的带GFP标签大肠杆菌作为内置菌，加入前在荧光显微镜下计数定量，再混入样品中参与从DNA提取、PCR、高通量测序整个过程，消除了实验过程中的操作误差，通过高通量的测序结果的相对丰度比例可以推算出各种菌落微生物的绝对定量；Lou J（PeerJ 6, 2018）提出了iHAAQ（Integrated High-Throughput Absolute Abundance Quantification）方法，利用与高通量测序相同的引物对DNA样品进行qPCR绝对定量，从而获得样品的细菌绝对总量，再与高通量测序所得的相对丰度相乘即可获得不同分类水平细菌的绝对含量。

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